$解:(1)由題,“水稻2號(hào)”試驗(yàn)田是邊長(zhǎng)為(a-1)米的正方形$
$∴“水稻1號(hào)”試驗(yàn)田的面積為(a^{2}-1)平方米$
$“水稻2號(hào)”試驗(yàn)田的面積為(a-1)^{2}平方米$
$∵a^{2}-1-(a-1)^{2}=2(a-1)$
$由題意可知,a>1, ∴2(a-1)>0,即a^{2}-1>(a-1)^{2}$
$\ ∵兩塊試驗(yàn)田的水稻都收獲了1000千克$
$∴“水稻2號(hào)”試驗(yàn)田的單位面積產(chǎn)量高$
$(2)\frac{1000}{(a-1)^{2}}÷\frac {1000}{a^{2}-1}=\frac{a+1}{a-1}$
$答:高的單位面積產(chǎn)量是低的單位面積產(chǎn)量的\frac {a+1}{a-1}倍.$